Paternity in Brazilian goats through the use of DNA microsatellites Paternidade em caprinos por meio de microssatélites de DNA

• Main Authors: Adriana Mello de Araújo, Simone Eliza Facioni Guimarães, Carmen Silva Pereira, Paulo Sávio Lopes, Marcelo Teixeira Rodrigues, Théa Mírian Medeiros Machado
• Format: Article
• Language: English
• Published: Sociedade Brasileira de Zootecnia 2010-05-01
• Series: Revista Brasileira de Zootecnia
• Subjects: Brasil; erro de pedigree; exclusão de paternidade; polimorfismo; raça naturalizada; Brazil; local breed; paternity exclusion; pedigree mismatching; polymorphism
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000500010
• ISSN: 1516-3598; 1806-9290

A total of 292 animals from three breeds (Alpine and Saanen dairy breeds, and the Brazilian naturalized breed Moxotó) were genotyped, comprising 276 paternity cases. Statistical analyses were carried out by using TFPGA and CERVUS programs. Heterozygosis ranged from 0.542 (ILSTS005) to 0.825 (INRA006), with an average of 0.717 for all loci. Polymorphic information content (PIC) was 0.676 and 0.542, and combined exclusion probabilities (EP) were 0.999591 and 0.988375 for known and unknown maternal genotypes, respectively. The microsatellite system reveals 10% of paternity misidentification in evaluated registers.<br>Um total de 292 animais de três raças (leiteiras Alpina e Saanen e a raça brasileira naturalizada Moxotó) foram genotipados, compreendendo 276 casos de paternidade. As análises estatísticas foram realizadas nos programas TFPGA e CERVUS. A heterozigosidade esperada variou de 0,542 (ILSTS005) a 0,825 (INRA006), com média de 0,717 para todos os loci. O conteúdo de informação polimórfica (Polymorphic information content, PIC) para todos os loci, foi de 0,676 e 0,542 e a probabilidade de exclusão (EP), de 0,999591 e 0,988375 para casos em que o genótipo materno era conhecido e desconhecido, respectivamente. A taxa de erro de identificação de paternidade é de 10% nos registros avaliados.