ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوری

به منظور ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه گیاه جو در مرحله زایشی تحت تنش شوری از 106 خانواده F8 حاصل از تلاقی دو رقم بادیا×کویر در سال 98-1397 استفاده شد. برای شناسایی QTL‌‌‌های کنترل کننده و برآورد اندازه اثر یک ازآن‌ها، از چهار روش نقشه‌یابی CIM، ICIM، STMIM و STPLM استفاده شد....

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: سمیه مختوم, حسین صبوری, عبدالطیف قلیزاده, لیلا آهنگر, مهناز کاتوزی, ابراهیم غلامعلی پور علمداری
Format: Article
Language:fas
Published: University of Birjand 2021-09-01
Series:Environmental Stresses in Crop Sciences
Subjects:
qtl
Online Access:https://escs.birjand.ac.ir/article_1719_c007c5b113020d29526b8638180a4501.pdf
id doaj-e75e10e8248a4b7e87b4166754265a22
record_format Article
spelling doaj-e75e10e8248a4b7e87b4166754265a222021-09-18T03:49:22ZfasUniversity of BirjandEnvironmental Stresses in Crop Sciences2228-76042383-30842021-09-0114377178110.22077/escs.2020.3163.18081719ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوریسمیه مختوم0حسین صبوری1عبدالطیف قلیزاده2لیلا آهنگر3مهناز کاتوزی4ابراهیم غلامعلی پور علمداری5دانشجوی ارشد بیوتکنولوژی، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبدکاووسدانشیار گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبدکاووساستادیار گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبدکاووساستادیار گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبدکاووسگروه اصلاح نباتات موسسه تحقیقات اگروسکوپ سوئیساستادیار گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبدکاووسبه منظور ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه گیاه جو در مرحله زایشی تحت تنش شوری از 106 خانواده F8 حاصل از تلاقی دو رقم بادیا×کویر در سال 98-1397 استفاده شد. برای شناسایی QTL‌‌‌های کنترل کننده و برآورد اندازه اثر یک ازآن‌ها، از چهار روش نقشه‌یابی CIM، ICIM، STMIM و STPLM استفاده شد. نقشه پیوستگی با استفاده از 152 نشانگر چند شکل SSR، 72 آلل ISSR ، 7 آلل IRAP، 29 آلل CAAT ، 27 آلل Scot و 15 آلل iPBS تهیه شد. نشانگرهای مولکولی استفاده شده روی 7 کروموزوم جو جایابی شدند. نقشه حاصل 999.2 سانتی‌مورگان طول ژنوم جو را پوشش داد و میانگین فاصله بین دو نشانگر مجاور از یکدیگر 3.387 سانتی‌مورگان شد. سه ناحیه مهم (کروموزوم یک در مکان 26 سانتی‌مورگان، کروموزوم 3 در مکان 44 سانتی‌مورگان و در کروموزوم 4 مکان 118 سانتی‌مورگان از تلومر انتهایی کروموزوم‌ها) با کلیه روش‌های مکان‌یابی برای صفات ارزیابی شده حاوی ژن‌های کمی مهم تشخیص داده شدند. از بین QTLهای شناسایی شده qSUG-4 (برای محتوی قند روی کروموزوم 4) با ضریب تبیین 2/20 و QTLهای qPHE-1 و qPHE-2 (برای محتوای فنول روی کروموزوم‌های 1 و2) به ترتیب با ضریب تبیین 3/21، 1/29 و qPER-1، qPER-4b، qPER-5، qPER-7 (برای پروکسیداز روی کروموزوم های 1، 4، 5 و 7) با اثرات تاثرگذار شناسائی شدند و پس از تایید اعتبار، کاندید مناسبی برای برنامه‌های اصلاحی انتخاب به کمک نشانگر در جمعیت‌های جو خواهند بود.https://escs.birjand.ac.ir/article_1719_c007c5b113020d29526b8638180a4501.pdfجو (.hordeum vulgare l)تنش شوریمتابولیت های ثانویهqtl
collection DOAJ
language fas
format Article
sources DOAJ
author سمیه مختوم
حسین صبوری
عبدالطیف قلیزاده
لیلا آهنگر
مهناز کاتوزی
ابراهیم غلامعلی پور علمداری
spellingShingle سمیه مختوم
حسین صبوری
عبدالطیف قلیزاده
لیلا آهنگر
مهناز کاتوزی
ابراهیم غلامعلی پور علمداری
ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوری
Environmental Stresses in Crop Sciences
جو (.hordeum vulgare l)
تنش شوری
متابولیت های ثانویه
qtl
author_facet سمیه مختوم
حسین صبوری
عبدالطیف قلیزاده
لیلا آهنگر
مهناز کاتوزی
ابراهیم غلامعلی پور علمداری
author_sort سمیه مختوم
title ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوری
title_short ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوری
title_full ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوری
title_fullStr ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوری
title_full_unstemmed ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.Hordeum vulgare L) تحت شرایط تنش شوری
title_sort ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه در جو (.hordeum vulgare l) تحت شرایط تنش شوری
publisher University of Birjand
series Environmental Stresses in Crop Sciences
issn 2228-7604
2383-3084
publishDate 2021-09-01
description به منظور ردیابی مکان‌های ژنی کنترل کننده متابولیت‌های ثانویه گیاه جو در مرحله زایشی تحت تنش شوری از 106 خانواده F8 حاصل از تلاقی دو رقم بادیا×کویر در سال 98-1397 استفاده شد. برای شناسایی QTL‌‌‌های کنترل کننده و برآورد اندازه اثر یک ازآن‌ها، از چهار روش نقشه‌یابی CIM، ICIM، STMIM و STPLM استفاده شد. نقشه پیوستگی با استفاده از 152 نشانگر چند شکل SSR، 72 آلل ISSR ، 7 آلل IRAP، 29 آلل CAAT ، 27 آلل Scot و 15 آلل iPBS تهیه شد. نشانگرهای مولکولی استفاده شده روی 7 کروموزوم جو جایابی شدند. نقشه حاصل 999.2 سانتی‌مورگان طول ژنوم جو را پوشش داد و میانگین فاصله بین دو نشانگر مجاور از یکدیگر 3.387 سانتی‌مورگان شد. سه ناحیه مهم (کروموزوم یک در مکان 26 سانتی‌مورگان، کروموزوم 3 در مکان 44 سانتی‌مورگان و در کروموزوم 4 مکان 118 سانتی‌مورگان از تلومر انتهایی کروموزوم‌ها) با کلیه روش‌های مکان‌یابی برای صفات ارزیابی شده حاوی ژن‌های کمی مهم تشخیص داده شدند. از بین QTLهای شناسایی شده qSUG-4 (برای محتوی قند روی کروموزوم 4) با ضریب تبیین 2/20 و QTLهای qPHE-1 و qPHE-2 (برای محتوای فنول روی کروموزوم‌های 1 و2) به ترتیب با ضریب تبیین 3/21، 1/29 و qPER-1، qPER-4b، qPER-5، qPER-7 (برای پروکسیداز روی کروموزوم های 1، 4، 5 و 7) با اثرات تاثرگذار شناسائی شدند و پس از تایید اعتبار، کاندید مناسبی برای برنامه‌های اصلاحی انتخاب به کمک نشانگر در جمعیت‌های جو خواهند بود.
topic جو (.hordeum vulgare l)
تنش شوری
متابولیت های ثانویه
qtl
url https://escs.birjand.ac.ir/article_1719_c007c5b113020d29526b8638180a4501.pdf
work_keys_str_mv AT smyhmkẖtwm rdyạbymḵạnhạyzẖnyḵntrlḵnndhmtạbwlythạytẖạnwyhdrjwhordeumvulgareltḥtsẖrạyṭtnsẖsẖwry
AT ḥsynṣbwry rdyạbymḵạnhạyzẖnyḵntrlḵnndhmtạbwlythạytẖạnwyhdrjwhordeumvulgareltḥtsẖrạyṭtnsẖsẖwry
AT ʿbdạlṭyfqlyzạdh rdyạbymḵạnhạyzẖnyḵntrlḵnndhmtạbwlythạytẖạnwyhdrjwhordeumvulgareltḥtsẖrạyṭtnsẖsẖwry
AT lylạậhngr rdyạbymḵạnhạyzẖnyḵntrlḵnndhmtạbwlythạytẖạnwyhdrjwhordeumvulgareltḥtsẖrạyṭtnsẖsẖwry
AT mhnạzḵạtwzy rdyạbymḵạnhạyzẖnyḵntrlḵnndhmtạbwlythạytẖạnwyhdrjwhordeumvulgareltḥtsẖrạyṭtnsẖsẖwry
AT ạbrạhymgẖlạmʿlypwrʿlmdạry rdyạbymḵạnhạyzẖnyḵntrlḵnndhmtạbwlythạytẖạnwyhdrjwhordeumvulgareltḥtsẖrạyṭtnsẖsẖwry
_version_ 1717377024159383552