Variabilidade genética em cultivares de soja determinada com marcadores microssatélites em gel de agarose Genetic variability of soybean cultivars obtained through microsatellite markers in agarose gel

• Main Authors: Elisa Serra Negra Vieira, Ivan Schuster, Rosane Bezerra da Silva, Marco Antônio Rott de Oliveira
• Format: Article
• Language: English
• Published: Embrapa Informação Tecnológica 2009-11-01
• Series: Pesquisa Agropecuária Brasileira
• Subjects: caracterização de cultivar; conteúdo de informação polimórfica; diversidade genética; frequência alélica; marcador SSR; cultivar characterization; polymorphic information content; genetic diversity; allelic frequency; SSR marker
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009001100013
• ISSN: 0100-204X; 1678-3921

O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de cultivares de soja com marcadores microssatélites selecionados e caracterizados quanto à informatividade para uso em gel de agarose. O DNA de 23 cultivares de soja foi amplificado com 283 marcadores microssatélites em gel de agarose a 3%. Posteriormente, 53 marcadores que apresentaram polimorfismo facilmente detectável nos géis de agarose foram utilizados na caracterização de 53 cultivares. Nessas cultivares foram detectados 124 alelos, com média de 2,34 alelos por loco, e os valores de conteúdo de informação polimórfica variaram entre 0,16 e 0,66, com média de 0,47. As frequências alélicas variaram de 0,02 a 0,91, com média de 0,43. A distância genética calculada variou de 0,02 a 0,73, com média de 0,47. A menor distância observada foi entre as cultivares CD201 e CD208, e a maior distância entre CD210 e BRSMT Uirapuru. Os marcadores utilizados possibilitaram a identificação das 53 cultivares avaliadas. Os locos microssatélites de soja, avaliados em gel de agarose, apresentam elevada informatividade. É possível detectar variabilidade significativa no germoplasma brasileiro de soja avaliado, mesmo entre cultivares elite, quando se usa marcadores moleculares microssatélites selecionados por sua informatividade.<br>The objective of this work was to evaluate the genetic variability of soybean cultivars with microsatellite markers selected and characterized for their informativity to be used in agarose gel system. The DNA of 23 soybean cultivars was amplified with 283 microsatellite markers, using a 3% agarose gel systems. The 53 markers with clearly detectable polymorphism in the agarose gels were used to characterize 53 cultivars. In these 53 cultivars, 124 alleles were detected, with an average of 2.34 alleles per locus. Polymorphism information content values varied between 0.16 and 0.66, with an average of 0.47. Allele frequencies were of 0.02 to 0.91, with an average of 0.43. Genetic distance was of 0.02 to 0.73, with an average value of 0.47. The shortest distance was between cultivars CD201 and CD208, and the largest between CD210 and BRSMT Uirapuru. The markers used permitted the identification of all bean 53 cultivars. The soybean microssatellite loci evaluated in agarose gel presented high informativity. It is possible to detect significant variability in the Brazilian soybean germplasm evaluated, even among elite cultivars, when microssatellite molecular markers, selected for their informativity, are used.