| Summary: | Este estudo apresenta e compara a composição florística das diatomáceas planctônicas e de sedimentos superficiais das represas de abastecimento do Sistema Alto Cotia (represas Pedro Beicht e Cachoeira da Graça), inseridas na Reserva Florestal do Morro Grande. Foram realizadas coletas em sete estações nos períodos seco e chuvoso, e de sedimento superficial no período seco. As amostragens foram acompanhadas de análises físicas e químicas da água. Foram identificados 23 táxons distribuídos em 11 gêneros. São disponibilizados dados morfométricos, comentários relevantes e distribuição espacial das espécies. A riqueza foi mais elevada no sedimento, com oito espécies exclusivas. A análise de agrupamento indicou que a composição das diatomáceas variou mais entre compartimentos (água e sedimento) do que entre represas ou períodos climáticos. O trabalho acresce três novas ocorrências para o Brasil e, além dessas, quatro para o Estado de São Paulo, contribuindo com informações inéditas em represas de abastecimento consideradas como referência para a Região Metropolitana de São Paulo.
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