Assessment of genetic diversity in the Russian olive (Elaeagnus angustifolia) based on ISSR genetic markers Avaliação da diversidade genética em Oliva Russa (Elaeagnus angustifolia) com base em marcadores genéticos ISSR

• Main Authors: Leila Sadat Asadiar, Fatemeh Rahmani, Abbas Siami
• Format: Article
• Language: English
• Published: Universidade Federal do Ceará 2013-06-01
• Series: Revista Ciência Agronômica
• Subjects: Dendrograma; Oliva russa; Variação genética; Marcador molecular; Dendrogram; Russian olive; Genetic variation; Molecular marker
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902013000200013
• ISSN: 0045-6888; 1806-6690

Elaeagnus is a Eurasian tree with 77 species worldwide. In this study, ISSR markers were used to establish the level of genetic relationships and polymorphism across nine genotypes of Elaeagnus angustifolia collected from 9 different regions of West Azarbaijan province. The ISSR analysis with 11 anchored primers also generated 116 scorable loci, of which 92 were polymorphic (79.3%). The estimated Jaccard similarity coefficient ranged from 0.44 to 0.76 for the ISSR markers. Cluster analysis was carried out, based on the Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Averages (UPGMA) and the dendrogram drawn with the help of the NTSYSpc 2.02 software. The analysis revealed 5 main clusters for the ISSR data. According to our results, there is a relatively high genetic distance across E. angustifolia genotypes in the West Azarbaijan province of Iran. Furthermore, it could be inferred that ISSR markers are suitable tools for the evaluation of genetic diversity and relationships within the Elaeagnus genus.<br>A Elaeagnus é uma árvore da Eurásia com 77 espécies em todo o mundo. Neste estudo, marcadores ISSR foram usados para estabelecer o nível de relações genéticas e polimorfismo entre nove genótipos de Elaeagnus angustifolia, coletados em 9 diferentes regiões da província do Azerbaijão Ocidental. A análise ISSR, com 11 primers ancorados, também gerou 116 loci contáveis, dos quais 92 polimórficos (79,3%). O coeficiente de similaridade de Jaccard estimado, variou de 0,44 a 0,76 para os marcadores ISSR. A análise de agrupamento foi realizada com base no Método não-ponderado de pares não-agrupados, com médias aritméticas (UPGMA), e a dendrograma elaborada com a ajuda do software NTSYSpc 2.02. A análise revelou cinco grupos principais para os dados ISSR. De acordo com nossos resultados, há uma distância genética relativamente alta entre genótipos de E. angustifolia na província de Azarbaijan Ocidental no Iran. Além disso, pode-se inferir que os marcadores ISSR são ferramentas adequadas para a avaliação da diversidade genética e as relações dentro do gênero Elaeagnus.