Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar
În acest studiu am analizat modalitatea optimă de poziţionare a cut off-ului în cadrul analizei cantitative a infiltratului inflamator în cancerul mamar cu ajutorul sistemului HistoQuest. Am utilizat specimene de ţesut mamar tumoral, care au fost marcate imunohistochimic cu markerii CD68 (pentru mac...
Main Authors: | , , , , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | English |
Published: |
Sciendo
2014-09-01
|
Series: | Romanian Journal of Laboratory Medicine |
Subjects: | |
Online Access: | https://doi.org/10.2478/rrlm-2014-0035 |
id |
doaj-aca48c15cf9e4f1384fa585c2e7e0363 |
---|---|
record_format |
Article |
spelling |
doaj-aca48c15cf9e4f1384fa585c2e7e03632021-09-05T14:01:30ZengSciendoRomanian Journal of Laboratory Medicine2284-56232014-09-0122333534510.2478/rrlm-2014-0035rrlm-2014-0035Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamarVrânceanu Anca-Raluca0Tărniceriu Cristina Claudia1Jitaru Daniela2Terinte Cristina3Zugun-Eloae Florin4Carasevici Eugen5Department of Oncology, Regional Institute of Oncology, Iaşi, România;Department of Anatomy Sciences - “Grigore T. Popa” University of Medicine and Pharmacy, Iaşi, RomâniaLaboratory of Immunology and Genetics, Regional Institute of Oncology Iaşi, România;Department of Pathology, Regional Institute of Oncology, Iaşi, RomâniaLaboratory of Immunology and Genetics, Regional Institute of Oncology Iaşi, RomâniaLaboratory of Immunology and Genetics, Regional Institute of Oncology Iaşi, România;În acest studiu am analizat modalitatea optimă de poziţionare a cut off-ului în cadrul analizei cantitative a infiltratului inflamator în cancerul mamar cu ajutorul sistemului HistoQuest. Am utilizat specimene de ţesut mamar tumoral, care au fost marcate imunohistochimic cu markerii CD68 (pentru macrofage) şi CD8 (pentru limfocitul T citotoxic) şi ulterior analizate automat pe regiunile IT (intratumoral), PT (peritumoral) şi FI (front de invazie) cu ajutorul sistemului soft HistoQuest. Pentru evidenţierea populaţiei de celule pozitive pe histograme şi scatergrame, este necesară poziţionarea cut off-ului (discriminator). Pentru optimizarea tehnicii, am comparat 5 modalităţi de poziţionare a cut off-ului. Rezultatele obţinute statistic pentru markerul CD8 pentru toate cele 5 tipuri de cutoff aplicate pe regiunile IT, PT şi FI nu au înregistrat diferenţe semnificative statistic (p < 0,05). Pentru markerul CD68 s-au înregistrat diferenţe semnificative statistic (p<0,05) între cut off-urile alese pe criterii manuale (cut off-ul C2-manual şi cut off -ul C3-medie manual) versus cut off-urile stabilite pe criterii ce ţin de soft (cut off-ul C1-automat, cut off-ul C4-regiune negativă şi cut off-ul C5-medie automat), utilizarea cutoff-ului automat fiind preferat pentru a îndepărta factorul subiectiv. Utilizarea modalităţii de poziţionare automată a cut off-ului generează date obiective şi reproductibile şi poate fi utilizat în analize cantitative ulterioarehttps://doi.org/10.2478/rrlm-2014-0035the quantitative analysiscut-offinflammatory infiltratesbreast canceranaliză cantitativăcut offinfiltrat inflamatorcancer mamar |
collection |
DOAJ |
language |
English |
format |
Article |
sources |
DOAJ |
author |
Vrânceanu Anca-Raluca Tărniceriu Cristina Claudia Jitaru Daniela Terinte Cristina Zugun-Eloae Florin Carasevici Eugen |
spellingShingle |
Vrânceanu Anca-Raluca Tărniceriu Cristina Claudia Jitaru Daniela Terinte Cristina Zugun-Eloae Florin Carasevici Eugen Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar Romanian Journal of Laboratory Medicine the quantitative analysis cut-off inflammatory infiltrates breast cancer analiză cantitativă cut off infiltrat inflamator cancer mamar |
author_facet |
Vrânceanu Anca-Raluca Tărniceriu Cristina Claudia Jitaru Daniela Terinte Cristina Zugun-Eloae Florin Carasevici Eugen |
author_sort |
Vrânceanu Anca-Raluca |
title |
Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar |
title_short |
Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar |
title_full |
Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar |
title_fullStr |
Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar |
title_full_unstemmed |
Optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /Optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar |
title_sort |
optimisation of the quantitative analysis of inflammatory cell infiltrates in breast cancer /optimizarea analizei cantitative a infiltratului celular inflamator în cancerul mamar |
publisher |
Sciendo |
series |
Romanian Journal of Laboratory Medicine |
issn |
2284-5623 |
publishDate |
2014-09-01 |
description |
În acest studiu am analizat modalitatea optimă de poziţionare a cut off-ului în cadrul analizei cantitative a infiltratului inflamator în cancerul mamar cu ajutorul sistemului HistoQuest. Am utilizat specimene de ţesut mamar tumoral, care au fost marcate imunohistochimic cu markerii CD68 (pentru macrofage) şi CD8 (pentru limfocitul T citotoxic) şi ulterior analizate automat pe regiunile IT (intratumoral), PT (peritumoral) şi FI (front de invazie) cu ajutorul sistemului soft HistoQuest. Pentru evidenţierea populaţiei de celule pozitive pe histograme şi scatergrame, este necesară poziţionarea cut off-ului (discriminator). Pentru optimizarea tehnicii, am comparat 5 modalităţi de poziţionare a cut off-ului. Rezultatele obţinute statistic pentru markerul CD8 pentru toate cele 5 tipuri de cutoff aplicate pe regiunile IT, PT şi FI nu au înregistrat diferenţe semnificative statistic (p < 0,05). Pentru markerul CD68 s-au înregistrat diferenţe semnificative statistic (p<0,05) între cut off-urile alese pe criterii manuale (cut off-ul C2-manual şi cut off -ul C3-medie manual) versus cut off-urile stabilite pe criterii ce ţin de soft (cut off-ul C1-automat, cut off-ul C4-regiune negativă şi cut off-ul C5-medie automat), utilizarea cutoff-ului automat fiind preferat pentru a îndepărta factorul subiectiv. Utilizarea modalităţii de poziţionare automată a cut off-ului generează date obiective şi reproductibile şi poate fi utilizat în analize cantitative ulterioare |
topic |
the quantitative analysis cut-off inflammatory infiltrates breast cancer analiză cantitativă cut off infiltrat inflamator cancer mamar |
url |
https://doi.org/10.2478/rrlm-2014-0035 |
work_keys_str_mv |
AT vranceanuancaraluca optimisationofthequantitativeanalysisofinflammatorycellinfiltratesinbreastcanceroptimizareaanalizeicantitativeainfiltratuluicelularinflamatorincancerulmamar AT tarniceriucristinaclaudia optimisationofthequantitativeanalysisofinflammatorycellinfiltratesinbreastcanceroptimizareaanalizeicantitativeainfiltratuluicelularinflamatorincancerulmamar AT jitarudaniela optimisationofthequantitativeanalysisofinflammatorycellinfiltratesinbreastcanceroptimizareaanalizeicantitativeainfiltratuluicelularinflamatorincancerulmamar AT terintecristina optimisationofthequantitativeanalysisofinflammatorycellinfiltratesinbreastcanceroptimizareaanalizeicantitativeainfiltratuluicelularinflamatorincancerulmamar AT zuguneloaeflorin optimisationofthequantitativeanalysisofinflammatorycellinfiltratesinbreastcanceroptimizareaanalizeicantitativeainfiltratuluicelularinflamatorincancerulmamar AT carasevicieugen optimisationofthequantitativeanalysisofinflammatorycellinfiltratesinbreastcanceroptimizareaanalizeicantitativeainfiltratuluicelularinflamatorincancerulmamar |
_version_ |
1717810078426333184 |