Comparison between ectodomain and G2 region of G glycoprotein for genotyping of HRSV Comparação entre o ectodomínio e a região G2 da glicoproteína G para genotipagem de HRSV
The Human Respiratory Syncytial Virus (HRSV), isolated in 1955, is the main cause of hospitalization of babies and infants with respiratory illness. Several studies have been conducted worldwide aiming the development of a safe and effective vaccine against HRSV. The G2 region of glycoprotein G is u...
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Format: | Article |
Language: | English |
Published: |
Sociedade Brasileira de Microbiologia
2007-09-01
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Series: | Brazilian Journal of Microbiology |
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Online Access: | http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822007000300005 |
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doaj-9a9a807080694dd0b8dcf40719e4c8452020-11-25T01:18:12ZengSociedade Brasileira de MicrobiologiaBrazilian Journal of Microbiology1517-83821678-44052007-09-0138341341610.1590/S1517-83822007000300005Comparison between ectodomain and G2 region of G glycoprotein for genotyping of HRSV Comparação entre o ectodomínio e a região G2 da glicoproteína G para genotipagem de HRSVAngélica Cristine de Almeida CamposEdison Luiz DurigonAndréa Lima LealTereza Souza SilvaPatrícia Alves Ramos BossoClaudia Trigo Pedroso MoraesDanielle Bruna Leal OliveiraHildener Nogueira LimaSandra Elisabete VieiraViviane Fongaro BotossoPaolo Marinho de Andrade ZanottoKlaus Eberhard StewienThe Human Respiratory Syncytial Virus (HRSV), isolated in 1955, is the main cause of hospitalization of babies and infants with respiratory illness. Several studies have been conducted worldwide aiming the development of a safe and effective vaccine against HRSV. The G2 region of glycoprotein G is used as genotyping default. In the present study, we performed a phylogenetic analysis of G protein and a comparative study between G2 region and ectodomain of attachment glycoprotein. Fifty-three nasal swab samples from children less than 5 years old and presenting symptoms of acute respiratory illness, assisted at the University Hospital (UH) of University of Sao Paulo (USP) in 2004, were submitted to sequencing by PCR and compared with GenBank sequences. We concluded that the G2 region is adequate for HRSV genotyping.<br>O vírus respiratório sincicial humano (HRSV), isolado em 1955, é a principal causa da hospitalização de bebês e crianças pequenas com sintomas de doença respiratória. No mundo inteiro, vários estudos para o desenvolvimento de uma vacina segura e eficiente contra o HRSV têm tido alta prioridade. A região G2 da glicoproteína G é usada como padrão para genotipagem do HRSV. Neste estudo, foi realizada a análise filogenética da glicoproteína G e o estudo comparativo entre a região G2 e o ectodomínio dessa glicoproteína. Cinquenta e três amostras de swab nasal de crianças com menos de cinco anos de idade, apresentando doença respiratória aguda, atendidas no Hospital Universitário (HU) da Universidade de São Paulo durante o ano de 2004, foram submetidas a sequenciamento por PCR e comparadas com seqüências do GenBank. A região G2 mostrou ser adequada para a genotipagem do HRSV.http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822007000300005Vírus Respiratório Sincicial HumanoGlicoproteína GRegião G2Análise FilogenéticaHuman Respiratory Syncytial VirusG GlycoproteinG2 RegionPhylogenetic Analysis |
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Angélica Cristine de Almeida Campos Edison Luiz Durigon Andréa Lima Leal Tereza Souza Silva Patrícia Alves Ramos Bosso Claudia Trigo Pedroso Moraes Danielle Bruna Leal Oliveira Hildener Nogueira Lima Sandra Elisabete Vieira Viviane Fongaro Botosso Paolo Marinho de Andrade Zanotto Klaus Eberhard Stewien |
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Angélica Cristine de Almeida Campos Edison Luiz Durigon Andréa Lima Leal Tereza Souza Silva Patrícia Alves Ramos Bosso Claudia Trigo Pedroso Moraes Danielle Bruna Leal Oliveira Hildener Nogueira Lima Sandra Elisabete Vieira Viviane Fongaro Botosso Paolo Marinho de Andrade Zanotto Klaus Eberhard Stewien Comparison between ectodomain and G2 region of G glycoprotein for genotyping of HRSV Comparação entre o ectodomínio e a região G2 da glicoproteína G para genotipagem de HRSV Brazilian Journal of Microbiology Vírus Respiratório Sincicial Humano Glicoproteína G Região G2 Análise Filogenética Human Respiratory Syncytial Virus G Glycoprotein G2 Region Phylogenetic Analysis |
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The Human Respiratory Syncytial Virus (HRSV), isolated in 1955, is the main cause of hospitalization of babies and infants with respiratory illness. Several studies have been conducted worldwide aiming the development of a safe and effective vaccine against HRSV. The G2 region of glycoprotein G is used as genotyping default. In the present study, we performed a phylogenetic analysis of G protein and a comparative study between G2 region and ectodomain of attachment glycoprotein. Fifty-three nasal swab samples from children less than 5 years old and presenting symptoms of acute respiratory illness, assisted at the University Hospital (UH) of University of Sao Paulo (USP) in 2004, were submitted to sequencing by PCR and compared with GenBank sequences. We concluded that the G2 region is adequate for HRSV genotyping.<br>O vírus respiratório sincicial humano (HRSV), isolado em 1955, é a principal causa da hospitalização de bebês e crianças pequenas com sintomas de doença respiratória. No mundo inteiro, vários estudos para o desenvolvimento de uma vacina segura e eficiente contra o HRSV têm tido alta prioridade. A região G2 da glicoproteína G é usada como padrão para genotipagem do HRSV. Neste estudo, foi realizada a análise filogenética da glicoproteína G e o estudo comparativo entre a região G2 e o ectodomínio dessa glicoproteína. Cinquenta e três amostras de swab nasal de crianças com menos de cinco anos de idade, apresentando doença respiratória aguda, atendidas no Hospital Universitário (HU) da Universidade de São Paulo durante o ano de 2004, foram submetidas a sequenciamento por PCR e comparadas com seqüências do GenBank. A região G2 mostrou ser adequada para a genotipagem do HRSV. |
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