AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR

ABSTRACT   Exploration of thermophilic bacteria that produce thermostable enzyme is most useful in application for enzyme base industrial. The aim of of this research is to isolate and amplificate the 16S-rRNA gene from thermophilic bacteria isolate at hotspring, Mount of Pancar, Bogor. The research...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Suryani -, Laksmi Ambarsari, Efi Sanfitri Harahap
Format: Article
Language:Indonesian
Published: Department of Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Universitas Andalas 2015-02-01
Series:Jurnal Riset Kimia
Online Access:http://jrk.fmipa.unand.ac.id/index.php/jrk/article/view/97
id doaj-992f667ddf3848dfa6524fe3e3b30932
record_format Article
spelling doaj-992f667ddf3848dfa6524fe3e3b309322020-11-25T01:50:30ZindDepartment of Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Universitas AndalasJurnal Riset Kimia1978-628X2476-89602015-02-013110.25077/jrk.v3i1.9779AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGORSuryani -Laksmi AmbarsariEfi Sanfitri HarahapABSTRACT   Exploration of thermophilic bacteria that produce thermostable enzyme is most useful in application for enzyme base industrial. The aim of of this research is to isolate and amplificate the 16S-rRNA gene from thermophilic bacteria isolate at hotspring, Mount of Pancar, Bogor. The research steps consist of bacteria isolation, chromosomal DNA extraction, and amplification of 16S-rRNA gene. The water sample as source for bacteria was collected from four cauldrons. Temperature and pH for each cauldron are red cauldron 75-80°C, pH 7; black cauldron 55°C, pH 7; white cauldron 57°C, pH 7; and saline cauldron 25°C, pH 6, respectively. The bacteria were cultivated at Luria Bertani (LB) and Thermus media. The chromosomal DNA have been extracted. Gene amplification of 16 S-rRNA have been carried out by using universal primer (Bac F1 and Uni B1). The size of amplicon is ± 1.5kb.   Keywords : thermophilic bacteria, chromosomal DNA extraction, amplification of 16S-rRNA genehttp://jrk.fmipa.unand.ac.id/index.php/jrk/article/view/97
collection DOAJ
language Indonesian
format Article
sources DOAJ
author Suryani -
Laksmi Ambarsari
Efi Sanfitri Harahap
spellingShingle Suryani -
Laksmi Ambarsari
Efi Sanfitri Harahap
AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR
Jurnal Riset Kimia
author_facet Suryani -
Laksmi Ambarsari
Efi Sanfitri Harahap
author_sort Suryani -
title AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR
title_short AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR
title_full AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR
title_fullStr AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR
title_full_unstemmed AMPLIFIKASI GEN 16S-rRNA BAKTERI TERMOFILIK DARI SUMBER AIR PANAS, GUNUNG PANCAR BOGOR
title_sort amplifikasi gen 16s-rrna bakteri termofilik dari sumber air panas, gunung pancar bogor
publisher Department of Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Universitas Andalas
series Jurnal Riset Kimia
issn 1978-628X
2476-8960
publishDate 2015-02-01
description ABSTRACT   Exploration of thermophilic bacteria that produce thermostable enzyme is most useful in application for enzyme base industrial. The aim of of this research is to isolate and amplificate the 16S-rRNA gene from thermophilic bacteria isolate at hotspring, Mount of Pancar, Bogor. The research steps consist of bacteria isolation, chromosomal DNA extraction, and amplification of 16S-rRNA gene. The water sample as source for bacteria was collected from four cauldrons. Temperature and pH for each cauldron are red cauldron 75-80°C, pH 7; black cauldron 55°C, pH 7; white cauldron 57°C, pH 7; and saline cauldron 25°C, pH 6, respectively. The bacteria were cultivated at Luria Bertani (LB) and Thermus media. The chromosomal DNA have been extracted. Gene amplification of 16 S-rRNA have been carried out by using universal primer (Bac F1 and Uni B1). The size of amplicon is ± 1.5kb.   Keywords : thermophilic bacteria, chromosomal DNA extraction, amplification of 16S-rRNA gene
url http://jrk.fmipa.unand.ac.id/index.php/jrk/article/view/97
work_keys_str_mv AT suryani amplifikasigen16srrnabakteritermofilikdarisumberairpanasgunungpancarbogor
AT laksmiambarsari amplifikasigen16srrnabakteritermofilikdarisumberairpanasgunungpancarbogor
AT efisanfitriharahap amplifikasigen16srrnabakteritermofilikdarisumberairpanasgunungpancarbogor
_version_ 1715648400227041280