Genetic variants identified by target next-generation sequencing in heart transplant patients with dilated cardiomyopathy

• Main Authors: Elisabete Martins, Alexandra Sousa, Paulo Canedo, Sérgio Leite, Roberto Pinto, Manuel Campelo, Sandra Amorim, Brenda Moura, José Manuel Lopes, José Carlos Machado, José Silva Cardoso
• Format: Article
• Language: English
• Published: Elsevier 2019-06-01
• Series: Revista Portuguesa de Cardiologia
• Online Access: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0870255117304298

Introduction and Objectives: Dilated cardiomyopathy (DCM) is a myocardial disease that can progress to a terminal stage, requiring heart transplantation. In this work we aim to contribute to knowledge of genetic variants in adult patients undergoing heart transplantation due to end-stage DCM, reporting the results obtained in our single-center tertiary hospital series using target next-generation sequencing (NGS). Methods and Results: Genetic variants were screened in 15 genes, preselected based on variants previously identified in DCM patients. Thirteen unrelated patients were included, nine (69%) male, mean age at diagnosis 33±13 years, eight (62%) with familial DCM. Nine genetic variants were identified in six (46%) patients: five in LMNA, two in LBD3, one in TNNT2 and one in TCAP. These variants were new in most patients. The majority were classified as of uncertain significance. Two patients were double and triple heterozygotes in the LBD3 and LMNA genes, respectively. Conclusion: Our results highlight the potential of NGS in the genetic characterization of DCM patients. LMNA is one of the most frequently mutated genes and should be included in all target gene assessments of end-stage DCM patients until more data are available. Resumo: Introdução e objetivos: A miocardiopatia dilatada é uma doença miocárdica que pode evoluir para um estádio terminal, requerendo transplante cardíaco. Neste trabalho, pretendemos contribuir para o conhecimento das variantes genéticas presentes em pacientes adultos submetidos a transplante cardíaco, descrevendo os resultados obtidos utilizando técnicas de sequenciação de ADN de nova geração. Métodos e resultados: Variantes genéticas foram pesquisadas em 15 genes pré-selecionados com base em variantes previamente identificadas em pacientes com miocardiopatia dilatada. Foram incluídos 13 pacientes não relacionados, nove (69%) do sexo masculino, com idade média na altura do diagnóstico de 33±13 anos, oito (62%) com doença familiar. Foram identificadas nove variantes genéticas em seis (46%) pacientes: LMNA-5, LBD3-2, TNNT2-1 e TCAP- 1. A maioria das variantes genéticas foi classificada como de significado incerto. Dois pacientes eram heterozigotos duplos e triplos nos genes LBD3 e LMNA, respetivamente. Conclusões: Os nossos resultados reforçam o potencial das novas tecnologias de sequenciação na caracterização genética de doentes com miocardiopatia dilatada. Até que mais dados estejam disponíveis, o gene LMNA é um dos mais frequentemente envolvidos e deverá ser incluído na avaliação de pacientes com miocardiopatia dilatada em fase terminal. Keywords: Dilated cardiomyopathy, Heart transplantation, Next-generation sequencing, Genetic variants, Palavras-chave: Miocardiopatia dilatada, Transplante cardíaco, Sequenciação de nova geração, Variantes genéticas