Evaluación de un protocolo automatizado para la obtención de medidas morfométricas de huevos de aves a partir de fotografías digitales

• Main Authors: V. M. Ramírez–Arrieta, D. Denis, Y. Ferrer–Sánchez
• Format: Article
• Language: English
• Published: Museu de Ciències Naturals de Barcelona 2020-10-01
• Series: Animal Biodiversity and Conservation
• Subjects: Automatización; Morfometría; Procesamiento de imágenes digitales; Oología; Dimensiones de huevos
• Online Access: https://www.raco.cat/index.php/ABC/article/view/384945
• ISSN: 1578-665X; 2014-928X

Muchos estudios ecomorfológicos están limitados por el tiempo que demora la recopilación manual de mediciones. Por ello, las innovaciones metodológicas han dado tanta importancia a la automatización del proceso. En el presente trabajo se elabora, implementa y valida un protocolo para la obtención semiautomatizada de un conjunto de variables morfométricas de los huevos de las aves a partir de fotografías digitales. El protocolo se implementó en lenguaje R como una aplicación web llamada OvometriK que, luego de binarizar y calibrar las imágenes, permite calcular once variables utilizando funciones geométricas y trigonométricas. Se prueban varias vías de cálculo, suponiendo la continuidad del contorno o por conteo de vóxeles. La aplicación se valida con figuras geométricas y 30 huevos de gallina medidos manualmente. La validación matemática con círculos mostró que el algoritmo fue capaz de medir los diámetros con gran precisión, con una correlación del 99,9 %. El error de estimación fue del 1,4 % en promedio. La estimación del volumen por métodos matemáticos lo subestima en un 27 %, mientras que por conteo de vóxeles solo lo subestima en un 6 %. La diferencia entre las medidas manuales de los diámetros de los huevos y las obtenidas a partir de las imágenes fue inferior a 3 mm (4 %). La correlación entre el volumen estimado y medido por vaciado con gel de sílice fue superior al 90 % cuando se emplea el método de conteo de vóxeles. Ni el ángulo de inclinación de los huevos ni la resolución de las fotografías tuvieron efectos significativos (diferencia máxima del 3,2 %). Las mediciones mostraron una replicabilidad alta y representaron un ahorro significativo de tiempo. El protocolo representa una mejora respecto de las limitaciones de plataforma, la accesibilidad y el número de variables en comparación con programas anteriores, además de que su carácter abierto y flexible permite adaptarlo a otras aplicaciones específicas.