مقایسه روش‌های GBLUP و بیزی در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی با معماری‌های مختلف ژنتیکی

• Main Authors: رضا سید شریفی, فاطمه علاء نوشهر, نعمت هدایت ایوریق, جمال سیف دواتی
• Format: Article
• Language: fas
• Published: Ferdowsi University of Mashhad 2020-07-01
• Series: پژوهشهای علوم دامی ایران
• Subjects: gblup; بیزa; بیزb; بیزc; بیزlasso; ارزش اصلاحی ژنومی
• Online Access: https://ijasr.um.ac.ir/article_36846_6250b856155a4d4a15afa7b611f800d3.pdf
• ISSN: 2008-3106; 2423-4001

انتخاب ژنومی با استفاده از نشانگرهای با تراکم بالا، بخصوص SNPهایی که کل ژنوم را پوشش می­دهند و اغلب در عدم تعادل پیوستگی با QTLهای مجاور خود قرار دارند، ارزش ژنتیکی کل را پیش­بینی می­کند. این پژوهش با هدف بررسی تأثیر عواملی چون تراکم نشانگرها، تعداد QTL، وراثت­پذیری صفت و نوع توزیع اثر QTL بر صحت برآورد ارزش­های اصلاحی ژنومی با استفاده از داده­های شبیه­سازی در گوسفند انجام گرفت. به همین منظور ژنومی متشکل از سه کروموزوم، هر یک به طول 100 سانتی­مورگان با سه مقدار وراثت­پذیری برای صفت مورد بررسی (1/0، 3/0 و 5/0) و سه پنل نشانگری (500، 1000 و 1500) در سه سطح تعداد QTL (50، 100 و 150) با دو اثر توزیع یکنواخت و گاما برای QTL شبیه­سازی شدند. صحت ارزش­های اصلاحی ژنومی برآورد شده با استفاده از پنج روش GBLUP، بیزA، بیزB، بیزC و بیز LASSO مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج این تحقیق نشان داد که هر چه تراکم نشانگر و وراثت­پذیری صفت افزایش یافته و تعداد QTL مؤثر بر صفت کمتر باشد، صحت ارزش اصلاحی برآورد شده بالاتر خواهد بود. در بین روش­های آماری زمانی که تعداد QTL مؤثر بر صفت پایین است و توزیع اثر QTL گاما در نظر گرفته شد، پیش­بینی ارزش­های اصلاحی ژنومی با روش بیزB عملکرد بهتری داشت.