A simplified DNA extraction method for PCR analysis of Camarotella spp.

This work aimed to optimize an efficient and simple protocol for DNA extraction of Camarotella species, an obligate plant pathogen that cause verrucosis or "lixa" on coconut tree and other palms, facilitating the molecular studies of these biotrophic microorganisms. The method proposed ena...

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Bibliographic Details
Main Authors: Nadja Santos Vitória, José Luiz Bezerra, Karina Peres Gramacho
Format: Article
Language:English
Published: Instituto de Tecnologia do Paraná (Tecpar) 2010-04-01
Series:Brazilian Archives of Biology and Technology
Subjects:
DNA
PCR
Online Access:http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132010000200001
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spelling doaj-60922e521ebb4008b4183f634a91f8112020-11-25T00:16:46ZengInstituto de Tecnologia do Paraná (Tecpar)Brazilian Archives of Biology and Technology1516-89131678-43242010-04-0153224925210.1590/S1516-89132010000200001A simplified DNA extraction method for PCR analysis of Camarotella spp.Nadja Santos VitóriaJosé Luiz BezerraKarina Peres GramachoThis work aimed to optimize an efficient and simple protocol for DNA extraction of Camarotella species, an obligate plant pathogen that cause verrucosis or "lixa" on coconut tree and other palms, facilitating the molecular studies of these biotrophic microorganisms. The method proposed enabled a fast, reproducible and reliable DNA extraction from Camarotella species.<br>A extração e amplificação de DNA são etapas fundamentais para a aplicação de métodos moleculares e para tal, a origem do material é relevante. As espécies do gênero Camarotella que causam as lixas do coqueiro e outras palmeiras são biotróficas e o crescimento em meio artificial é controverso, embora Oliveira et. al, (2004) tenham registrado seu cultivo in vitro, utilizando meio líquido completo. No entanto, não ficou provado que o micélio formado correspondia ao micélio de Camarotella. Em conseqüência das dificuldades com o cultivo dos agentes etiológicos das lixas, foi otimizado um protocolo para extração de DNA genômico a partir do himênio ascógeno in natura e um protocolo de PCR para sua amplificação. Nossos resultados são importantes para o estudo da família Phyllachoraceae, pois possibilitará a análise molecular que, nessa família, é limitada pela dificuldade de obtenção de DNA.http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132010000200001Camarotella torrendiellaC. acrocomiaeverrucosis on coconutDNAPCR
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publisher Instituto de Tecnologia do Paraná (Tecpar)
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issn 1516-8913
1678-4324
publishDate 2010-04-01
description This work aimed to optimize an efficient and simple protocol for DNA extraction of Camarotella species, an obligate plant pathogen that cause verrucosis or "lixa" on coconut tree and other palms, facilitating the molecular studies of these biotrophic microorganisms. The method proposed enabled a fast, reproducible and reliable DNA extraction from Camarotella species.<br>A extração e amplificação de DNA são etapas fundamentais para a aplicação de métodos moleculares e para tal, a origem do material é relevante. As espécies do gênero Camarotella que causam as lixas do coqueiro e outras palmeiras são biotróficas e o crescimento em meio artificial é controverso, embora Oliveira et. al, (2004) tenham registrado seu cultivo in vitro, utilizando meio líquido completo. No entanto, não ficou provado que o micélio formado correspondia ao micélio de Camarotella. Em conseqüência das dificuldades com o cultivo dos agentes etiológicos das lixas, foi otimizado um protocolo para extração de DNA genômico a partir do himênio ascógeno in natura e um protocolo de PCR para sua amplificação. Nossos resultados são importantes para o estudo da família Phyllachoraceae, pois possibilitará a análise molecular que, nessa família, é limitada pela dificuldade de obtenção de DNA.
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