Evaluation of Self-Incompatibility Locus Diversity of Domestic Plum (Prunus Domestica L.) using DNA-Based S-Genotyping

• Main Authors: Kota-Dombrovska Irita, Lācis Gunārs
• Format: Article
• Language: English
• Published: Sciendo 2013-08-01
• Series: Proceedings of the Latvian Academy of Sciences. Section B, Natural Sciences
• Subjects: prunus; plums; self-incompatibility; genetics; molecular markers
• Online Access: https://doi.org/10.2478/prolas-2013-0017

Joprojām ir nepietiekama informācija par pašnesadcribas iedzimšanu mājas plūmēm (P. domestica L.). Salīdzinājumā ar citām Prunus sugām, tām nav izstrādāti ,9-alēlēm specifiski molekulārie marķieri, identificētas šķirņu saderības grupas, nav zināma pašnesaderibas lokusa daudzveidība. Tāpēc, izmantojot sešus citām Prunus sugām izstrādātos S-lokusam specifiskos molekulāros marķierus, tika veikta 33 mājas plūmju genotipēšana. Lietotie marķieri uzrādīja labu starpsugu pārnesi un nodrošināja augstu ģenētisko daudzveidību (konstatēti 14-37 amplifikācijas fragmenti, vidējā heterozigotāte - 0,953). Izmantotie molekulārie marķieri uzrādīja augstu izšķirtspēju un nodrošināja visu pētījumā iekļauto mājas plūmju šķirņu identifikāciju. Pamatojoties uz iegūtajiem rezultātiem, praimeru pāri EM-PC2consFD/ EM-PC3consRD, PasPcons-Fl/ PaClcons-Rl un F-Box50A/ F-Box intronR tiek rekomendēti kā papildus marķieri plūmju augu materiāla raksturošanai un identifikācijai. Lai gan pētījumā lietotie molekulārie marķieri nespēja grupēt plūmju šķirnes pēc to piederības pašsaderības gupām (pašsaderīgas, daļēji pašsaderīgas un pašnesaderīgas), tika identificēti katrai no šīm grupām unikāli amplifikācijas fragmenti, kas izmantojami turpmākajā darbā, izstrādājot saderības grupām specifiskos marķierus.