Comparative study of Chalcone synthase promoters across plant families

• Main Authors: Francisco Buitrago, Roberto Sierra, Alejandro Grajales, Luis Miguel Rodríguez, Pedro Jiménez, Adriana Bernal, Silvia Restrepo
• Format: Article
• Language: Spanish
• Published: Universidad Nacional de Colombia 2009-07-01
• Series: Revista Colombiana de Biotecnología
• Subjects: Promoter; Chalcone synthase; Cis elements; Floral expression; Promotores; Chalcón sintetasa
• Online Access: https://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/11754
• ISSN: 0123-3475; 1909-8758

Estudio comparativo de promotores de la Chalcón Sintasa en diferentes familias de plantas In the post – genomic era the understanding of gene regulation has become a challenge and a research priority. In this research, we performed a comparative study of the regulator sequences of the chalcone synthase gene across plant families. Twenty-two sequences of chalcone synthase promoters were compared considering three regulator Cis elements: G-Box, H-Box and TATA Box. Our results show that these Cis elements are conserved among species and even at the family level. However, in some species all of the Cis elements were not found, showing that the expression and regulation of these promoters via the Cis elements can be variable. Additionally, a comparison between promoters from a species with a chalcone synthase multigene family showed that the duplicate genes are variable in the composition of the Cis elements, suggesting that these genes could be expressing in different ways. Key Words: Promoter; Chalcone synthase; Cis elements; Floral expression. Resumen En la era post-genómica, el entendimiento de la regulación génica se ha convertido en un reto y una prioridad de investigación. En este trabajo realizamos un estudio comparativo de las secuencias reguladoras del gen de la chalcón sintetasa de varias familias botánicas. Veintidós secuencias de promotores de Chalcone Synthase fueron comparados teniendo en cuenta tres elementos Cis reguladores: Caja-G, Caja-H y Caja-TATA, que podrían estar actuando como una sola unidad cooperativa. Nuestra comparación muestra que estos elementos puede que se conserven en algunas especies e inclusive que se conserven a nivel de familia. Sin embargo, en algunas especies no todos los elementos Cis fueron encontrados, mostrando que no todas las especies se regulan bajo los mismos parámetros. Adicionalmente, una comparación entre promotores de una misma especie con una familia de multigenes Chs, mostró que los genes duplicados son variables en la composición del elemento Cis, sugiriendo que estos genes pueden estarse expresando de maneras diferentes. Palabras claves: Promotores; Chalcón sintetasa; Elementos Cis; Expresión floral.