Genetic evaluation for large data sets by random regression models in Nellore cattle Avaliação genética para grandes massas de dados por meio de modelos de regressão aleatória em gado Nelore

• Main Authors: P.R.C. Nobre, A.N. Rosa, L.O.C. Silva
• Format: Article
• Language: English
• Published: Universidade Federal de Minas Gerais 2009-08-01
• Series: Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia
• Subjects: bovino de corte; características múltiplas; regressão aleatória; beef cattle; multiple trait; random regression
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352009000400026
• ISSN: 0102-0935; 1678-4162

Expected progeny differences (EPD) of Nellore cattle estimated by random regression model (RRM) and multiple trait model (MTM) were compared. Genetic evaluation data included 3,819,895 records of up nine sequential weights of 963,227 animals measured at ages ranging from one day (birth weight) to 733 days. Traits considered were weights at birth, ten to 110-day old, 102 to 202-day old, 193 to 293-day old, 283 to 383-day old, 376 to 476-day old, 551 to 651-day old, and 633 to 733-day old. Seven data samples were created. Because the parameters estimates biologically were better, two of them were chosen: one with 84,426 records and another with 72,040. Records preadjusted to a fixed age were analyzed by a MTM, which included the effects of contemporary group, age of dam class, additive direct, additive maternal, and maternal permanent environment. Analyses were carried out by REML, with five traits at a time. The RRM included the effects of age of animal, contemporary group, age of dam class, additive direct, permanent environment, additive maternal, and maternal permanent environment. Different degree of Legendre polynomials were used to describe random effects. MTM estimated covariance components and genetic parameters for weight at birth and sequential weights and RRM for all ages. Due to the fact that correlation among the estimates EPD from MTM and all the tested RM were not equal to 1.0, it is not possible to recommend RRM to genetic evaluation to large data sets.<br>Compararam-se as diferenças esperadas nas progênies (DEPs) de gado Nelore, estimadas por meio de um modelo de características múltiplas (MTM), com um modelo de regressão aleatória (RRM). Foram utilizados 3.819.895 dados de peso corporal sequenciais para a avaliação genética de 963.227 animais, coletados do nascer aos 733 dias de idade. As características consideradas foram: peso ao nascer e pesos dos 10 aos 110, dos 102 aos 202, dos 193 aos 293, dos 283 aos 383, dos 376 aos 476, dos 467 aos 567, dos 551 aos 651, e dos 633 aos 733 dias. Sete amostras foram geradas. Duas amostras resultaram em estimativas de parâmetros mais consistentes do ponto de vista biológico, sendo, portanto consideradas representativas da população em estudo. A primeira amostra constituiu-se de 84.426 medidas, e a segunda, de 72.040. Os pesos pré-ajustados para as idades fixas foram analisados por meio de um MTM, com cinco características por processamento, no qual se incluíram efeito de grupo contemporâneo, classe de idade da vaca, aditivo direto, aditivo materno e ambiente materno permanente, utilizando-se a metodologia de máxima verossimilhança restrita (REML). Diferentes graus dos polinômios de Legendre foram utilizados em um RRM, para os efeitos aleatórios. As correlações entre as DEPs estimadas por meio do modelo para características múltiplas e de regressão aleatória não foram iguais a 1,0, portanto, não se recomenda a utilização dos modelos de regressão aleatória para avaliação genética para grande massa de dados.