شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin)
مقدمه: آسپرژیلوس‌ها جنس متنوعی از قارچ‌های رشته‌ای شامل گروه‌ها و گونه‌های متعدد هستند. شناسایی این قارچ‌ها از جنبه‌های مختلف مانند بیماری‌زایی، توکسین‌زایی و صنعتی حایز اهمیت است. روش‌های معمول آزمایشگاهی برای افتراق گونه‌های آسپرژیلوس شامل بررسی خصوصیات ظاهری و میکرو سکوپی كلنی می‌باشد. روش‌های فو...
| Main Authors: | , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Vesnu Publications
2012-02-01
|
| Series: | مجله دانشکده پزشکی اصفهان |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/1139 |
| id |
doaj-23b560f4f20a4abcb17efd64c91d5018 |
|---|---|
| record_format |
Article |
| spelling |
doaj-23b560f4f20a4abcb17efd64c91d50182020-11-24T21:55:11ZfasVesnu Publications مجله دانشکده پزشکی اصفهان1027-75951735-854X2012-02-012916622622271820شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin)Gholamreza Shokohi0Hossein Mirhendi1Parivash Kordbacheh2Mahnaz Nikaeen3Ali Rezaei-Matehkolaei4Mahdi Abastabar5MSc Student, Department of Medical Parasitology and Mycology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, IranAssociate Professor, Department of Medical Parasitology and Mycology, School of Public Health, National Institute of Health Research, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, IranProfessor, Department of Medical Parasitology and Mycology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, IranAssociate Professor, Department of Environmental Health Engineering, School of Health, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, IranAssistant Professor, Department of Medical Mycoparasitology, School of Medicine, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, IranPhD Student, Department of Medical Parasitology and Mycology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iranمقدمه: آسپرژیلوس‌ها جنس متنوعی از قارچ‌های رشته‌ای شامل گروه‌ها و گونه‌های متعدد هستند. شناسایی این قارچ‌ها از جنبه‌های مختلف مانند بیماری‌زایی، توکسین‌زایی و صنعتی حایز اهمیت است. روش‌های معمول آزمایشگاهی برای افتراق گونه‌های آسپرژیلوس شامل بررسی خصوصیات ظاهری و میکرو سکوپی كلنی می‌باشد. روش‌های فوق وقت گیر بوده و احتیاج به پرسنل مجرب دارد. هدف مطالعه‌ی حاضر، استفاده از تعیین توالی ژن بتا توبولین همراه با داده‌های مورفولوژیک برای شناسایی گونه‌های آسپرژیلوس جدا شده از برخی محیط‌ها در ایران بود. روش‌ها: در این مطالعه حدود 200 سویه‌ی آسپرژیلوس جدا شده از خاک و هوای محیط‌های مختلف، اعم از بیمارستان و اماکن طبیعی و عمومی مورد استفاده قرار گرفتند. تمام ایزوله‌ها روی محیط‌های چاپکس آگار و سابورو کشت مجدد شدند و پس از کشت روی لام مورد شناسایی اولیه قرار گرفتند. DNAی ژنومی تمام ایزوله‌ها به روش خرد كردن با گریندر استخراج گردید و به دنبال آن ژن بتا توبولین (β-tubulin) هر یک از نمونه‌ها از طریق واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (Polymeraze chain reaction یا PCR) تقویت گردید و از بین آن‌ها 21 ایزوله به عنوان نمایندگان خصوصیات ماکروسکوپی و میکروسکوپی تعیین توالی گردیدند و داده‌های حاصل از طریق مقایسه با اطلاعات بانک ژن مورد بررسی و آنالیز قرار گرفت. یافته‌ها: از بین 21 ایزوله‌ی آسپرژیلوس که تعیین توالی شدند، 7 جدایه به عنوان آسپرژیلوس فلاووس (Aspergillus flavus)، 3 جدایه آسپرژیلوس فومیگاتوس (A. fumigates)، 3 جدایه آسپرژیلوس چوالیری (A. chevalieri)، 2 جدایه آسپرژیلوس توبینژنسیس (A. tubingensis)، 2 جدایه آسپرژیلوس نیوئوگلاکوس (A. niveoglacus)، 2 جدایه به عنوان آسپرژیلوس روبر (A. ruber)، یک جدایه آسپرژیلوس نایجر (A. niger) و یک جدایه نیز به عنوان آسپرژیلوس ورسیکالر (A. versicolor) شناسایی شدند. یافته‌های مورفولو‍‍ژی با نتایج ژنوتیپی تأیید گردید. نتیجه‌گیری: یافته‌های این مطالعه نشان داد که تعیین توالی ژن بتا توبولین برای شناسایی جدایه‌های محیطی آسپرژیلوس در سطح گونه بسیار با ارزش است و این روش، اعتبار بیشتری در مقایسه با بررسی ریخت شناسی جدایه‌ها دارد. استفاده از دیگر اهداف ژنتیکی و روش‌های مولکولی مبتنی بر DNA برای مطالعه‌ی بیشتر گونه‌های آسپرژیلوس توصیه می‌شود.http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/1139AspergillusBeta tubulinIdentification |
| collection |
DOAJ |
| language |
fas |
| format |
Article |
| sources |
DOAJ |
| author |
Gholamreza Shokohi Hossein Mirhendi Parivash Kordbacheh Mahnaz Nikaeen Ali Rezaei-Matehkolaei Mahdi Abastabar |
| spellingShingle |
Gholamreza Shokohi Hossein Mirhendi Parivash Kordbacheh Mahnaz Nikaeen Ali Rezaei-Matehkolaei Mahdi Abastabar شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin) مجله دانشکده پزشکی اصفهان Aspergillus Beta tubulin Identification |
| author_facet |
Gholamreza Shokohi Hossein Mirhendi Parivash Kordbacheh Mahnaz Nikaeen Ali Rezaei-Matehkolaei Mahdi Abastabar |
| author_sort |
Gholamreza Shokohi |
| title |
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin) |
| title_short |
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin) |
| title_full |
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin) |
| title_fullStr |
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin) |
| title_full_unstemmed |
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin) |
| title_sort |
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (β-tubulin) |
| publisher |
Vesnu Publications |
| series |
مجله دانشکده پزشکی اصفهان |
| issn |
1027-7595 1735-854X |
| publishDate |
2012-02-01 |
| description |
مقدمه: آسپرژیلوس‌ها جنس متنوعی از قارچ‌های رشته‌ای شامل گروه‌ها و گونه‌های متعدد هستند. شناسایی این قارچ‌ها از جنبه‌های مختلف مانند بیماری‌زایی، توکسین‌زایی و صنعتی حایز اهمیت است. روش‌های معمول آزمایشگاهی برای افتراق گونه‌های آسپرژیلوس شامل بررسی خصوصیات ظاهری و میکرو سکوپی كلنی می‌باشد. روش‌های فوق وقت گیر بوده و احتیاج به پرسنل مجرب دارد. هدف مطالعه‌ی حاضر، استفاده از تعیین توالی ژن بتا توبولین همراه با داده‌های مورفولوژیک برای شناسایی گونه‌های آسپرژیلوس جدا شده از برخی محیط‌ها در ایران بود.
روش‌ها: در این مطالعه حدود 200 سویه‌ی آسپرژیلوس جدا شده از خاک و هوای محیط‌های مختلف، اعم از بیمارستان و اماکن طبیعی و عمومی مورد استفاده قرار گرفتند. تمام ایزوله‌ها روی محیط‌های چاپکس آگار و سابورو کشت مجدد شدند و پس از کشت روی لام مورد شناسایی اولیه قرار گرفتند. DNAی ژنومی تمام ایزوله‌ها به روش خرد كردن با گریندر استخراج گردید و به دنبال آن ژن بتا توبولین (β-tubulin) هر یک از نمونه‌ها از طریق واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (Polymeraze chain reaction یا PCR) تقویت گردید و از بین آن‌ها 21 ایزوله به عنوان نمایندگان خصوصیات ماکروسکوپی و میکروسکوپی تعیین توالی گردیدند و داده‌های حاصل از طریق مقایسه با اطلاعات بانک ژن مورد بررسی و آنالیز قرار گرفت.
یافته‌ها: از بین 21 ایزوله‌ی آسپرژیلوس که تعیین توالی شدند، 7 جدایه به عنوان آسپرژیلوس فلاووس (Aspergillus flavus)، 3 جدایه آسپرژیلوس فومیگاتوس (A. fumigates)، 3 جدایه آسپرژیلوس چوالیری (A. chevalieri)، 2 جدایه آسپرژیلوس توبینژنسیس (A. tubingensis)، 2 جدایه آسپرژیلوس نیوئوگلاکوس (A. niveoglacus)، 2 جدایه به عنوان آسپرژیلوس روبر (A. ruber)، یک جدایه آسپرژیلوس نایجر (A. niger) و یک جدایه نیز به عنوان آسپرژیلوس ورسیکالر (A. versicolor) شناسایی شدند. یافته‌های مورفولو‍‍ژی با نتایج ژنوتیپی تأیید گردید.
نتیجه‌گیری: یافته‌های این مطالعه نشان داد که تعیین توالی ژن بتا توبولین برای شناسایی جدایه‌های محیطی آسپرژیلوس در سطح گونه بسیار با ارزش است و این روش، اعتبار بیشتری در مقایسه با بررسی ریخت شناسی جدایه‌ها دارد. استفاده از دیگر اهداف ژنتیکی و روش‌های مولکولی مبتنی بر DNA برای مطالعه‌ی بیشتر گونه‌های آسپرژیلوس توصیه می‌شود. |
| topic |
Aspergillus Beta tubulin Identification |
| url |
http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/1139 |
| work_keys_str_mv |
AT gholamrezashokohi sẖnạsạyymwrfwlwzẖyḵwzẖnwtypyḵbrkẖyjdạyhhạyậsprzẖylwsmḥyṭydrạyrạnbrạsạstwạlyzẖnbtạtwbwlynbtubulin AT hosseinmirhendi sẖnạsạyymwrfwlwzẖyḵwzẖnwtypyḵbrkẖyjdạyhhạyậsprzẖylwsmḥyṭydrạyrạnbrạsạstwạlyzẖnbtạtwbwlynbtubulin AT parivashkordbacheh sẖnạsạyymwrfwlwzẖyḵwzẖnwtypyḵbrkẖyjdạyhhạyậsprzẖylwsmḥyṭydrạyrạnbrạsạstwạlyzẖnbtạtwbwlynbtubulin AT mahnaznikaeen sẖnạsạyymwrfwlwzẖyḵwzẖnwtypyḵbrkẖyjdạyhhạyậsprzẖylwsmḥyṭydrạyrạnbrạsạstwạlyzẖnbtạtwbwlynbtubulin AT alirezaeimatehkolaei sẖnạsạyymwrfwlwzẖyḵwzẖnwtypyḵbrkẖyjdạyhhạyậsprzẖylwsmḥyṭydrạyrạnbrạsạstwạlyzẖnbtạtwbwlynbtubulin AT mahdiabastabar sẖnạsạyymwrfwlwzẖyḵwzẖnwtypyḵbrkẖyjdạyhhạyậsprzẖylwsmḥyṭydrạyrạnbrạsạstwạlyzẖnbtạtwbwlynbtubulin |
| _version_ |
1725864271128035328 |