Data Exporter: A complementary tool to export data simulation from NEURON

• Main Authors: Óscar Emilio Hernández, Daladier Jabba, Fabián Muñoz
• Format: Article
• Language: English
• Published: Universidad del Norte 2013-01-01
• Series: Salud Uninorte
• Subjects: data exporter; herramienta de simulación computacional; len; guaje de programación hoc de neuron; geometrías neuronales complejas; po; tenciales de acción
• Online Access: http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=81730430014

Objetivos: Desarrollar una herramienta computacional en ambiente lenguaje de pro- gramación hoc de NEURON y de fácil uso, que permita el rápido almacenamiento de los resultados obtenidos para su posterior análisis en otros software tales como Matlab or IgorPro. Materiales y métodos: Para el desarrollo de Data Exporter se escribió un algoritmo en lenguaje de programación hoc de NEURON. El algoritmo, escrito en un único archivo de texto, esta dividido en 13 bloques, de los cuales solo el primero debe ser modificado para adaptarlo a una geometría y biofísica neuronal particular y para determinar la ruta de almacenamiento de los datos. Resultados: Se desarrollo un software que simula la propagación de potenciales de ac- ción a través de geometrías neuronales complejas. El uso de esta herramienta permite el almacenamiento de los resultados obtenidos, como potenciales y corrientes de membrana en diferentes puntos de toda la neurona, sin incremento significativo en el tiempo para el desarrollo de los procesos. Conclusiones: Data Exporter es un software que le da mayor flexibilidad a NEURON facilitando el acceso a nuevos neurocientíficos, los cuales pueden usarlo con solo conocer los códigos necesarios para el desarrollo de los archivos relacionados con las propiedades geométricas y biofísicas neuronales.