Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")

We biochemically analyzed and characterized the genetic structure of a population in danger of extinction ,"Alberes", a local cattle breed of the Catalonian Pyrenees (Spain and France). Ninety-two individuals were analyzed for five polymorphic genetic loci (Hb, Alb, Tf, Gc and Ptf2). The a...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: J. Jordana, J. Piedrafita, X. Carre, A. Martell
Format: Article
Language:English
Published: Sociedade Brasileira de Genética 1999-09-01
Series:Genetics and Molecular Biology
Online Access:http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47571999000300017
id doaj-18b6bd418e4e42f1b84805cb756a141f
record_format Article
spelling doaj-18b6bd418e4e42f1b84805cb756a141f2020-11-25T02:32:22ZengSociedade Brasileira de GenéticaGenetics and Molecular Biology1415-47571678-46851999-09-0122338739410.1590/S1415-47571999000300017Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")J. JordanaJ. PiedrafitaX. CarreA. MartellWe biochemically analyzed and characterized the genetic structure of a population in danger of extinction ,"Alberes", a local cattle breed of the Catalonian Pyrenees (Spain and France). Ninety-two individuals were analyzed for five polymorphic genetic loci (Hb, Alb, Tf, Gc and Ptf2). The animals were grouped according to coat color: Fagina Alberes variety (N = 39) and Black Alberes variety (N = 53). The genetic structures and relationships between these subpopulations and one "outgroup" breed ("Bruna dels Pirineus") were analyzed and compared by using F-statistics. We determined that inbreeding in the Alberes breed is not significant, since negative and nonsignificant FIT and FIS values were obtained. The average genetic differentiation between subpopulations within the Alberes breed was 1.5% (FST = 0.015; P < 0.05), with an effective number of 4.1 individuals exchanged between subpopulations per generation (gene flow). The results obtained in this study corroborate the potential danger of extinction of the breed. The Black Alberes variety is proposed as the principal nucleus of genetic conservation for this breed, as it seems to show a higher degree of genetic isolation from other foreign populations.<br>A estrutura génetica de uma população de Alberes, uma raça de gado dos Pirineus catalônicos (Espanha e França) em risco de extinção, foi analisada e caracterizada bioquimicamente. Noventa e dois indivíduos foram analisados para 5 loci genéticos polimórficos (Hb, Alb, Tf, Gc e Ptf2). Os animais foram agrupados de acordo com a cor do pêlo: variedade Fagina Alberes (N = 39) e Black Alberes (N = 53). As estruturas genéticas e as relações entre estas subpopulações e uma raça extra ("Bruna dels Pirineus") foram analisadas e comparadas pela estatística F. A endogamia na raça Alberes não foi significante, pois foram obtidos valores FIT e FIS negativos e não significantes. A diferenciação genética média entre as subpopulações dentro da raça Alberes foi 1,5% (FST = 0,015; P < 0,05), com um número efetivo de 4,1 indivíduos trocados entre as subpopulações por geração (fluxo de gene). Os resultados obtidos neste estudo confirmaram o perigo potencial de extinção da raça. A variedade Black Alberes é sugerida como o principal núcleo de conservação genética para esta raça, pois parece mostrar maior grau de isolamento genético em relação a outras populações estrangeiras.http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47571999000300017
collection DOAJ
language English
format Article
sources DOAJ
author J. Jordana
J. Piedrafita
X. Carre
A. Martell
spellingShingle J. Jordana
J. Piedrafita
X. Carre
A. Martell
Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")
Genetics and Molecular Biology
author_facet J. Jordana
J. Piedrafita
X. Carre
A. Martell
author_sort J. Jordana
title Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")
title_short Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")
title_full Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")
title_fullStr Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")
title_full_unstemmed Conservation genetics of an endangered Catalonian cattle breed ("Alberes")
title_sort conservation genetics of an endangered catalonian cattle breed ("alberes")
publisher Sociedade Brasileira de Genética
series Genetics and Molecular Biology
issn 1415-4757
1678-4685
publishDate 1999-09-01
description We biochemically analyzed and characterized the genetic structure of a population in danger of extinction ,"Alberes", a local cattle breed of the Catalonian Pyrenees (Spain and France). Ninety-two individuals were analyzed for five polymorphic genetic loci (Hb, Alb, Tf, Gc and Ptf2). The animals were grouped according to coat color: Fagina Alberes variety (N = 39) and Black Alberes variety (N = 53). The genetic structures and relationships between these subpopulations and one "outgroup" breed ("Bruna dels Pirineus") were analyzed and compared by using F-statistics. We determined that inbreeding in the Alberes breed is not significant, since negative and nonsignificant FIT and FIS values were obtained. The average genetic differentiation between subpopulations within the Alberes breed was 1.5% (FST = 0.015; P < 0.05), with an effective number of 4.1 individuals exchanged between subpopulations per generation (gene flow). The results obtained in this study corroborate the potential danger of extinction of the breed. The Black Alberes variety is proposed as the principal nucleus of genetic conservation for this breed, as it seems to show a higher degree of genetic isolation from other foreign populations.<br>A estrutura génetica de uma população de Alberes, uma raça de gado dos Pirineus catalônicos (Espanha e França) em risco de extinção, foi analisada e caracterizada bioquimicamente. Noventa e dois indivíduos foram analisados para 5 loci genéticos polimórficos (Hb, Alb, Tf, Gc e Ptf2). Os animais foram agrupados de acordo com a cor do pêlo: variedade Fagina Alberes (N = 39) e Black Alberes (N = 53). As estruturas genéticas e as relações entre estas subpopulações e uma raça extra ("Bruna dels Pirineus") foram analisadas e comparadas pela estatística F. A endogamia na raça Alberes não foi significante, pois foram obtidos valores FIT e FIS negativos e não significantes. A diferenciação genética média entre as subpopulações dentro da raça Alberes foi 1,5% (FST = 0,015; P < 0,05), com um número efetivo de 4,1 indivíduos trocados entre as subpopulações por geração (fluxo de gene). Os resultados obtidos neste estudo confirmaram o perigo potencial de extinção da raça. A variedade Black Alberes é sugerida como o principal núcleo de conservação genética para esta raça, pois parece mostrar maior grau de isolamento genético em relação a outras populações estrangeiras.
url http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47571999000300017
work_keys_str_mv AT jjordana conservationgeneticsofanendangeredcataloniancattlebreedalberes
AT jpiedrafita conservationgeneticsofanendangeredcataloniancattlebreedalberes
AT xcarre conservationgeneticsofanendangeredcataloniancattlebreedalberes
AT amartell conservationgeneticsofanendangeredcataloniancattlebreedalberes
_version_ 1724819714655387648